يعمل قسم التشغيل والصيانة والمرافق في الجامعة على ضمان تشغيل المرفق بأقصى كفاءة ممكنة وضمان استدامته لسنوات طويلة. ويتناغم القسم مع الخطط الاستراتيجية المختلفة للجامعة ومن أهمها تلك التي تهدف الى توفير بيئة آمنة ومحفزة للعمل والتعلم وتوفير البنية التحتية اللازمة لذلك. ويقدم القسم خدمات التشغيل والصيانة بواسطة فريق عمل مؤهل من موظفي الجامعة أو من الشركات المختصة والتي يتم التعاقد معها من أجل هذه الغرض. وتشمل خطط القسم ومهامه القيام بسلسلة من الإجراءات والعمليات المستمرة على المدى القصير والطويل من أجل وضع المعدات والأنظمة في حالة عمل مستمر وضمان حسن أداها والتقليل من حدوث الأعطال وتوقف الخدمات والعمل على إطالة عمرها الافتراضي. كما يعمل القسم على اعداد خطط الطوارئ المختلفة لمواجهة التحديات الطبيعية كالأمطار والفيضانات أو أخطار التشغيل والأعطال. وكجزء لا يتجزأ من الجامعة العربية المفتوحة يعمل القسم بالتعاون مع جميع الأقسام الأكاديمية والإدارية لإنجاح رسالة الجامعة للتميز في جميع ما تقدمه من خدمات.